在进行知网查重时，不同学科间的差异会影响到查重结果。首先，需要明确各学科的研究特点和常用的术语，以便更好地进行查重工作。其次，可以借助一些专业的查重软件，如知网、Turnitin等，这些软件能够识别不同学科的论文特点，提高查重的准确性。此外，还可以参考一些跨学科的查重方法，比如结合文献综述和实证研究的方式，综合考量不同学科的研究成果，避免查重时的误判。

另外，在进行知网查重时，还可以参考一些学术期刊的要求和标准，了解不同学科对于论文撰写的规范要求，避免因为学科差异而导致的查重问题。同时，建议在查重前对论文进行细致的修改和润色，确保文笔流畅、逻辑清晰，减少不必要的重复内容。最后，要注重引用规范，避免抄袭和剽窃，保证学术诚信，提高论文的质量和可信度。